Öncelikle upload inputunu array olarak tanımlamalısın.

<input name="resimler[]" type="file" multiple="multiple" />

PHP tarafında post durumunun içine aşağıdaki kodları yazabilirsin.

$total = count($_FILES['resimler ']['name']); //yüklenen toplam resimleri sayar
// döngü içinde yüklenenlere sırasıyla işlem yaptırabilirsin
for( $i=0 ; $i < $total ; $i++ ) {   



$geciciisim = $_FILES['resimler ']['tmp_name'][$i];  

//boş olmama kontrolü

 if ($geciciisim != ""){   

//dosya yolu ayarlanır

 $yeniyol = "./yukleme_dizini/" . $_FILES['resimler ']['name'][$i]; 

//dosya yükleme 

 if(move_uploaded_file($geciciisim , $yeniyol )) {    

//yükleme başarılı

//boyut kontrolü, görsel kontrolü vs bu if döngüsünün

dışında eklenmeli
}

} 

}