Cloudflare panelinize girin, SSL sekmesine basın.
Orada Flexible yazıyorsa Full'e, Full yazıyorsa Flexible'a çekip deneyin. İkisi de hata verirse off seçeneğini işaretleyip deneyin.
Her denemede gizli modu açıp kapatarak denemelerinizi yapın.

Dediğim gibi .htaccess dosyanızı veya nginx.conf'u(sites-enabled içindeki conflar da elbette) inceleyin çünkü bu yönlendirme sorunu sunucu ile Cloudflare arasındaki yönlendirme uyuşmazlığından kaynaklanmaktadır.