301 ile domaini değil url yide yönlendirebilirsiniz. 301 yönlendirme yapılması index almamasına sebebiyet vermez. İndex alır, tıklandığında site açılır ve 301 yönlendirilmesi gerçekleşir.
Sitenin kullandığı yöntemi buldum. Meğer bu google botları gelince site2.comu gösteriyormuş. Kullanıcı gelince kullanıcıyı site.com anasayfasına yönlendiriyor. Bunun adı cloak herhalde