Merhaba, öncelikle 301 yönlendirmelerini yapın. Ardından robot dosyanızdan bu linklere disallow verin. Daha sonra search console giderek kaldırma talebinde bulunun. 6 ay sonra botlar geldiğinde artık o url'leri göremeyecek ve yeni url'ler indexlenecek. Eğer search console'dan kaldırmazsanız bu sayfalar googleda 404 hatası verir. Kendi kendine kalkmaz.
htaccess ile zaten eski link yapısı 301 ile yeni link yapısına yonlendirilmiş durumda... dolayısıyla 404 hatası vermiyorlar sayfalar. Bilgi için teşekkürler.