hocam selamlar,
sorularınız ile ilgili hiçbir sorun yok, umarım kısa sürede kendinizi daha da geliştirirsiniz. asıl cevaba gelecek olursak, js ile bildirimleri sildiğiniz js function’ı içerisinden bir ajax requesti ile örneğin clear_notifications.php’ye istek atın. o sayfada da bildirimleri sıfıra (sessiondaki) çekin. bu sayede farklı bir sayfaya geçildiğinde sessiondan bildirim sayısı alındığında sıfır gelecek ve sayfa da yenilemenize gerek kalmayacak ajax requesti sayesinde. kolaylıklar gelsin

ajax isteği için örnek: https://www.w3schools.com/jquery/jqu...x_get_post.asp