cPanel den Directadmine geçişlerde
Wordpress ve bir çok yazılımda sorun yaşanmaz genelde.

Wordpress de wordfence eklentisi varsa public_html içersinde bulunan config dosyasından yeni dosya yolunu yazmanız yeterli /home/users olan dosya dizini /home/users/domains/ şekline değiştiği için bundan dolayı hata verir
opencart config.php ve admin config.php den yine dosya yolları düzeltilmesi gerek hata verecektir

En çok sorun laravel de çıkar alt dizinde olan sistem dosyalarını bir üst dizine taşımak şart. Dosyaları doğru dizine taşıyınca oda çalışacaktır