Destekleriniz için teşekkürler hocam. Olmadı destek bildirimi açarım. Cevap gelirse buradan bildiririm.

ayarlar gitmeyecek, fakat tema dosyalarında yaptığınız değişiklikler gider. çözümü ise; child theme kullanmaktır. böylece temanızda yaptığınız değişiklikler tema güncellemelerinde kaybolmaz.
şu anki durumda ise; değişiklikleri hatırlıyorsanız, yedekleri alıp güncellemeden sonra child theme oluşturup oraya ekleyebilirsiniz.