Sorunu çözdüm. Aynı sorunla karşılaşanlar içni paylaşıyorum. Aşağıdaki eklentiyi kurup etkinleştirdikten sonra Woocommerce / Ayarlar / Gönderim bölümünden "Gönderim seçenekleri" sekmesini açıyoruz. En alt kısımda Hide all other shipping methods and only show "Free Shipping" and "Local Pickup" seçiyoruz ve kaydediyoruz.
https://wordpress.org/plugins/wc-hide-shipping-methods/

@sinuos; hallettim hocam yukarıdaki yöntem ile teşekkürler