robots.txt dosyasından engelleme koyabilirsiniz, dizininizde boş bir index.php dosyasının olduğundan veya klasörlerde index dosyası yoksa girişin kapalı olduğundan emin misiniz ? Teknik olarak görüntülenmez ve indeks almaz bu kısımlar. Siz browserda site.com/wp-includes olarak giriş yaptığınızda dosyalarınızı görebiliyormusunuz ?