php.net dökümantasyonları ilk etapta anlaşılması zor gelsede gayet yeterli.
w3schools dökümantasyonlarınada göz gedirebilirsiniz.

En iyi öğrenme şekli sürekli birşeyleri geliştirme yolundan geçiyor.

Temeli oluşturmaya çalışın, CRUD işlemlerini kavramaya çalışın, sonra pdo yapısına bakın ve kendinize ufak bir hedef koyun.

Üyelik giriş ve kayıt formu oluşturmaya yönelik hedef koyun mesela. Kendiniz geliştirmeye çalışın. Bol bol takılacaksınız, takıldığınız yerlerde aramalarınızda stackoverflow gibi kaynaklarda güzel cevaplar bularak bir çok şeyi kavrayabilirsiniz. Sonraki aşamalarda class yapılarına bakarsınız ve frameworklere geçebilirsiniz.

Yani olayın %80'i birşeyler üretme isteği ve harekete geçmek. Sonrasında bir şekilde yapıyorsunuz zaten.