Hocam muhtemelen centos üzerine kurulum yaptınız siz.Centos ilk kurarken disk ayarını doğru yapmazsanız 50gb veriyor ana dizine.Siz önce domain yedeklerinizi alıp sıfırdan düzgün şekilde kuruum yapın.Google'de plesk panel ile ilgili makaleler mevcut.