şöyle yapabilirsiniz;

$sql_text = ''
if($kargo == 1){
     $sql_text .= ' AND kargo = 1';
}
$urun = $db->prepare("SELECT * FROM urun WHERE Kategori LIKE '%". $id . "%'".$sql_text);
;

bu şekilde gelen parametrelere göre istediğiniz kadar sorguya ekleme yapabilirsiniz