Search Console üzerinde Uluslararası Hedefleme kısmında Ülke sekmesinde hali hazırda seçili bir ülke var mı?

Çünkü, /en gibi klasör yapısı olan çok dilli sitelerde sitenin ülkesini seçmek sizin dediğiniz gibi bir soruna yol açabilir.

Edit: hreflang="tr" şeklinde belirtmek sadece dili belirtir. Fakat;

hreflang="ru-TR" yaparsak, Türkiye konumundaki Rusça dili olanları hedefler.

Bu yüzden de yapıyor olabilir.