SQL tarafında yapılabilir mi bilmiyorum ama PHP ile bu şekilde bir çözüm üretilebilir.
$query = $db->query("SELECT id FROM tablo")->fetchAll(2);
$basla = 2001;
foreach ($query as $item) {
$db->query("UPDATE tablo SET bos_sutun='{$basla}' WHERE id='{$item['id']}'");
$basla++;
}