aynı sorgu yu direkt mysql/phpmyadmin den çalıştırıp deneyin.
direkt çalıştırdığınızda da yavaş ise indexlemeyi göz atabilirsiniz, fakat bu sorgu yavaş çalışacak bir sorgu gibi gözükmüyor.
tabi bu tablolara sürekli update insert oluyorsa table lock dan dolayı da sorgunun cevabı yavaş dönüyor olabilir.