.htaccess'den HTTrack'i engellemediğinizden dolayı;
https://analiz.r10.net/htaccess-olusturucu

Kesin çözüm değildir, aşmam 1 dakikamı alır fakat hiç bir şey bilmeden sitenizin tasarımını kopyalamaya çalışan veletlerden kurtulmuş olursunuz en azından.
Bu arada bu programla sadece sitedeki .css .html .js ve resim dosyalarını alabilrisiniz.