Kimse net birşey söyleyemez sanıyorum, ama büyük olasılıkla seo açısından çok büyük fark olmaz. Ancak cdn hizmeti aldığınız yeri değiştirmek istediğinizde bu linkler de değişmek zorunda kalacak bunu da düşünmek lazım. Bu sebeple cdn.site.com tercih etmek önemli.