find ile yorum satırı starter ve end kısımlarının index verilerini alıp ardından onları "" ile sildirilebilir diye düşünüyorum.

>>> a = """
... /* qeqwe */
... q
... q
... q
... q
... q
... /* wqex */
... """
>>> a
'\n/* qeqwe */\nq\nq\nq\nq\nq\n/* wqex */\n'
>>> a.find("/*")
1
>>> a.find("*/")
10
>>> a[1:10] # '*/' karakterinin kendisini de dahil edersek index 12 ye çıkar
'/* qeqwe '
>>> a[1:12]
'/* qeqwe */'
>>> a.replace(a[1:12],"") # replace ile o veriyi "" verisine eşitleyerek sildik.
'\n\nq\nq\nq\nq\nq\n/* wqex */\n' # sonuçta gözükmemekte bunu alttaki kısım için de yapılabilir
>>>

eğer 2 kısım arasını silmek istenirse
a.rfind('*/')
bu sayede sondaki */ index verisi bulunur onunla
a.find('/*')
2 index arasını replace ile "" tanımlarsanız silinmiş olucaktır. ^^

iyi çalışmalar.