Birinci sorunuz için, modallar tablar gibi özellikleri daha manuel kullanabilmek için jquery kullanabilirsiniz. Yani hayati bir önemi yok ama daha işlevsel tasarımlar için öğrenmenizde fayda var.
İkincisi için, yani evet diyebiliriz. jQuery ile javascripti daha sade kullanıyorsunuz. Bu nedenle direkt jQuery öğrenebilirsiniz şahsen ben öyle başlamıştım.