Dizine ekli demek Google aramalarında var demek (Her sayfa için ayrı ayrı). Google'dan yok olduysa dizine ekli değildir. Canlı test yapmaktan başka bir çözüm yok.
Sitenizi site:siteadi.com şeklinde arattığınızı varsayıyorum. Orada olmayan her sayfa dizine ekli değil demektir. Anasayfanızın linkinin orada çıkmadığını anladım ben.