Merhaba hocam
https://www. sitepoint .com/build-javascript-countdown-timer-no-dependencies/
incelemenizi öneririm.
PHP ile konuşturacaksanız bunun neticesini PHP ile alsanız daha iyi olur.
Zaman farkının sebebi ise PHP - Sunucu, JavaScript - Tarayıcınızı baz alır/oralarda çalışırlar.

P.S.
Hatta direk şuna baksanız daha iyidir http:// countdownjs. org/