Hocam işlemlerde ajax mı kullanıyorsunuz?
Birde ssl hep var mıydı sitede?
Eğer ajax kullanıyorsanız ve ssl i sonradan aktiflestirdiyseniz bu da neden olabilir..
Ayrıca panel kodlamanız nasıl bilmiyorum ama htacsess kullanıyorsanız burada da bir engelleme olabilir..
Php ile alakalı bir hata olsaydı eror log a basar idi diye düşünüyorum.