Hocam normalde WordPress'te temayı yanlış kodlamadıysalar otomatik kendisi yapması lazım aslında.

/** * nofollow tag ekleme TDBilisim */
function add_nofollow_to_reply_link( $link ) { return str_replace( '")'>', '")' rel='nofollow'>', $link ); }
add_filter( 'comment_reply_link', 'add_nofollow_to_reply_link' );

Şunu functions.php'ye ekleyerek çözebilirsiniz.