Durduk yere olacak bir şey değil.

Silinme nedenleri şunlar olabilir;

Vds'in bulunduğu disk arızalanmış olabilir. (Fakat bu durumda diskin inactive şekilde görünmesi gerekir eğer bu durumdayken ana sunucuyu yeniden başlatırsanız diskte kaybolacaktır, loglardan bu durum tespit edilebilir)
Sunucu başka birinin vcenter'ine ekliyse vcenter erişimi olan biri uzaktan silmiş olabilir.
SSH-TELNET erişimi açıksa ve kolay bir şifre belirlediyseniz brute force ile şifre bulunmuş olabilir.