Merhaba,
CloudFlare nin önüne bir koruma sistemi ekleyemezsiniz. Eğer sistemde CloudFlare kullanılacaksa her zaman en önde CloudFlare olmak zorundadır. Aksi taktirde trafik CloudFlare ye ulaşmayacaktır. Eğer Free bir çözüm istiyorsanız tavsiyem, CloudFlare + Reverse Proxy + Web Server (Hosting Paneliniz) şeklindedir. Bazı Reverse Proxy yazılımları CloudFlare API sistemi ile çalışarak CloudFlare ye aksiyon aldırabilir.