Merhaba, istediğiniz şey basitçe Selenium gibi kütüphanelerle Web Whatsapp üzerinden yapılabilir. Onun dışında ben bu işin derinlerine dalmak istiyorum derseniz; Whatsapp soket teknolojisi üzerinden çalışmaktadır ve gelen/giden mesajlar
https://tr.0wikipedia.org/wiki/Curve25519 ve bir dizi başka metod ile şifrelenmektedir. Qr okutma vs. işlemlerini yaptıktan sonra reverse engineering yaparak mesaj okuma/gönderme işlemlerine bakmalısınız. Bunun için Python'da
https://github.com/sigalor/whatsapp-web-reveng böyle bir repo var ufuk açması ya da kafayı anlamanızda yardımı dokunacaktır.