Command Line olarak bu şekilde halledebilirsin ;
mysql -u root -p

set global net_buffer_length=1000000; -- Network Buffer'ını yükseltiyoruz

set global max_allowed_packet=1000000000; -- İzin verilen Paket limiti değerini arttırıyoruz

SET foreign_key_checks = 0; -- Foreign key kontrolünü kapatıyoruz.

source SQLDOSYASI.sql --Sql dosyanızı import ediyorsunuz

SET foreign_key_checks = 1; --Foreign key kontrolünü yeniden açıyorsunuz