Sub olanı eklerken public_html klasörüne değilde direkt main alana eklersen bu sorunu çözersin, ayrıca index almasını istemiyorsan robots.txt üzerinden disallow verebilirsin.
peki konudan bağlantısız olarak, burada paylaşılanların ana siteye zararı vb. olur mu? veya faydası? forum benzeri olacak ve az kelimeli yazılar olacak (10-20 kelimelik) sayfalar sözlük benzeri). ana sitemde uzun yazılar yazıyorum.