• Geçersiz dosya isimleri.
• Dosyaların herkes tarafından yazılabilir olması. PHP dosyalalarında en yaygın sorundur. Normal durumlarda PHP dosyalarının izinleri 775’ten büyük olmamalıdır. Ana dizinlerin ve klasörlerin izinleri de doğru şekilde ayarlanmalıdır.
• İçerik yönetim sistemlerinin (WordPress, Joomla vb.), forumların, blogların vb. uygulamaların manuel kurulumu sonrasında dosya izinlerinin geçersiz şekilde yapılandırılması.
• .htaccess dosyasının yanlış yapılandırılması.
• Uygulamalarda ve yazılımlardaki yanlış komutlar veya kodlama hataları.

Bu hatalara göz atabilirsiniz. Ek olarak tespiti için burayı kullanabilirsiniz güzel bir rehber olabilir sizin için.