Tam net bilgim yok ama sanırım yedekleme yönteminizden dolayı bu şekilde olmuş. Ben de yakın zamanda 30gb site verisinden yedekleme yapmıştım, 25 gb'si görsel idi ve sorun olmadı.
Çözüm olarak, Windows için toplu dosya adı değiştirebileceğiniz dosya komutları mevcut. Bomlanan görsellerdeki karakterlerin Türkçe karşılığını değiştirerek düzeltebilirsiniz isimleri. Büyük ve küçük harf karşılığına dikkat ettiğiniz sürece sorun olmaz. Bu işlemleri yapmadan önce yedek almayı unutmayın.