phpstorm ile temizleyebilirsiniz sanırım.

Temayı phpstorma atın, indexleyin ardından `CTRL` + `ALT` + `F` ile global aramayı açın.

Arama türünü regexe çevirin

Sırasıyla tespit ettiğiniz patternleri deneyin. Mesela ilk örnek

{5da5ac1ba6623

{5da ile başlayım 6623 ilen biten encryption bulup temizleyeceğiz diyelim.

{5da(.+?)6623 dedik, dosyalar sırası ile listenecektir. Sırasıyla bu kodları temanızdan kaldırın. Ama bu tarz şifreleme koyanlar bazı önemli js kodlarını da şifreliyor. Mesela yorum göndermenizi sağlayan ufak bir ajax kodu. Kaldırdığınızda yorum gönderilmiyor. Veya sizi bir sayfaya yönlendiren bir eventi durduran diğer bir event. Kaldırdığınızda siteye girdiğinizde, siteyi açar açmaz farklı bir siteye yönlendirebiliyor. Adım adım gitmenizde ve her işlemden sonra sitenizi test etmenizde fayda var.