iki sitede aynı sunucuda mı ?
database bağlantı dosyalarini değiştirmişmiydiniz ? bazı scriptlerde 2-3 tane database bağlantı dosyası oluyor değişim yapmasanız bile config dosyasında yer alan database bilgileri ile sunucuda aynı veritabanı olduğu için bağlantı sağlayip işlem yapabliyor misal x sitesinde düzenleme yaptığınızda y sitesindede bağlantılarınızı düzeltmezseniz aynsı y sitesinede gidebilir.
hocam siteyi kendim kodladım veritabanı dosyalarını değiştirdim fakat dbdeki 3 tablodan sürekli veriler siliniyor.