WildCard SSL Sertifikası temin etmelisin.
Let's Encrypt sınırsız sayıda sanıyorum subdomain kabul etmiyor.
Let's Encrypt sertifkayı oluşturma sırasında .*domain.com şeklinde oluşturmayı deneyebilirsin.
İlk önce subları kurarken ana domaine joker yani *domain.com ile sertifika aldım hocam. Daha sonra her sub kuruşumda bir kez daha Let's encrypt ile lisans aldım. İlk 50sinde sorun yok son50 tanesinde ssl yok maalesef *domain olarak seçmeme rağmen