25gb MySQL için çok önemli değil, sonuçta 32gb ram bedava,

slow queries i aktif hale getirip konsoldan izlemek gerekiyor,

tüm tabloların veri turleri ve kapasitelerini doğru olarak ayırdınız varsayımı ile,

insert yapılan tablolarda myisam, select yapılan tablolarda innodb kullanmak gerekiyor, eğer ayırma şansı yoksa büyük bir tablodan bahsediyorsak, innodb gerekiyor, eğer bu durumdaysak, ilk bakılması gereken Buffer memory size limit, toplam ramin %80 i olmalıdır, 16gb ram olan sunucuda 512mb ram verildiyse innodb akşama kadar CPU kasar, %300 %400 CPU görür ve sonunda da fail verir.