Hayır etkilnmez fakat kurdğunuz linuxun boot manageri ile windows aynı bölümde ise(ki dual bootta aynı olur) boot problemi olabilir. Dosyalar etkienmez fakat çözmesi biraz zorlar. Boot rescue dwediğimiz olay olur. Ama çokça yönerge var internette düzeltirsiniz. Hangi dağıtımı kurdunuz bu arada