Merhaba, öncelikle temanız legal yollardan alınmış olmalı. Tema malum sitelerden indirildiyse ne yaparsanız yapın bunun önüne geçemezsiniz.
Temada sorun yoksa eklentiler dahil her şeyi silerek tekrar kurulum yapmanız gerekiyor. Yedek aldığınız wp-content/uploads klasöründe de php ve js dosyaları aratın. Varsa onları temizleyin ve uploads klasörünü bu işlemleri yaptıktan sonra geri yükleyin. Tüm eklentileri WP içinden aratarak yükleyin. Manuel yükleme yapmayın. Tüm kullanıcı adı ve şifreleri değiştirin. Sizin açmadığınız kullanıcı hesapları olabilir, onları da silin. Wordpress veritabanı kullanıcı adı ve şifresini de cpanelden değiştirin. Bu şekilde verimli bir temizlik yapmış olursunuz.
Merhaba Tema Colormag teması ve Wordpress dizininden indirdim. Temadan kaynaklı değil sanırım muhtemelen dediğiniz gibi uploads klasöründen kaynaklanıyor olabilir. Belirttiğiniz adımları uygulayıp sonuçları göreceğim. Cevabınız için teşekkür ederim.