Aşağıdaki gibi file input un name alanının sonuna [] ekleyin.

<input type="file" name="resim[]" id="Resim" />

Çoklu seçim yapıldığında bu veriler post edildiği sayfaya array olarak gidecek. Post edilen sayfada foreach loop ile gelen her resimi tek tek kaydedebilirsiniz.