import.php olarak kaydet.

<?php
namespace XAWEBSqlImport;
use PDO;
use PDOException;
use Exception;
use Error;
class Import
{
private $db;
private $filename;
private $username;
private $password;
private $database;
private $host;
public function __construct($filename, $username, $password, $database, $host)
{
$this->filename = $filename;
$this->username = $username;
$this->password = $password;
$this->database = $database;
$this->host = $host;
$this->connect();
$this->openfile();
}
private function connect() {
try {
$this->db = new PDO("mysql:host=".$this->host.";dbname=".$this->database, $this->username, $this->password);
$this->db->setAttribute(PDO::ATTR_ERRMODE, PDO::ERRMODE_EXCEPTION);
} catch(PDOException $e) {
echo "Cannot connect: ".$e->getMessage()."n";
}
}
private function query($query)
{
try {
return $this->db->query($query);
} catch(Error $e) {
echo "Error with query: ".$e->getMessage()."n";
}
}
private function openfile()
{
try {
if (!file_exists($this->filename)) {
throw new Exception("Error: File not found.n");
}
$fp = fopen($this->filename, 'r');
$templine = '';
while (($line = fgets($fp)) !== false) {
    if (substr($line, 0, 2) == '--' || $line == '') {
        continue;
}
    $templine .= $line;
    if (substr(trim($line), -1, 1) == ';') {
$this->query($templine);
        $templine = '';
    }
}
fclose($fp);
} catch(Exception $e) {
echo "Error importing: ".$e->getMessage()."n";
}
}
}

Bunuda kendine göre düzenle aynı dizinde sql dosyanı at. SQL boyutundan kaynaklanabiliyor bu tip hatalar harici olarak PDO kütüphanesinde düzeltmeler var işini görür.. Bu arada işlemi yapmadan önce veritabanında hiç birşey olmadığına emin ol tabloları sil yani.

<?php
require('import.php');
use XAWEBSqlImportImport;
$filename = 'vtdosyan.sql';
$username = 'vt kullanıcı adın';
$password = 'veritabanı şifren';
$database = 'veritabanın';
$host = 'localhost';
new Import($filename, $username, $password, $database, $host);

Edit:SQL BOYUTU ÇOK YÜKSEK İSE PHP ZAMAN AŞIMINI KALDIR.