Merhaba. Sorunu tam olarak anlamamakla birlikte yüklemeye çalıştığınız dosyanın boyutunun yüksek olması ve sunucuda web üzerinden dosya yükleme için daha düşük belirlenmiş olması ihtimaline binaen bu durumu yaşadığınızı düşünüyorum.

Çözüm için my.cnf dosyasındaki ve PHP.ini dosyalarındaki limitleri yükseltmenizi tavsiye ediyorum. upload_max_filesize ve timeout ile ilgili değerleri yükseltmelisiniz.