Eğer bir kod parçası şifreleniyor, sonra bir yerde kullanılırken tekrar çözülüyorsa o kod başkası tarafından da çözülebilir. Yani kesinlikle kırılmaması gerekiyorsa bu işlemi şifreleme ile çözemezsiniz. Ancak ve ancak süreyi uzatırsınız 1-2 gün. IonCube de olsa fark etmez. Sadece amatörleri atlatırsınız.

Bu yüzden yapınızı değiştirmeniz gerekiyor. Örneğin script satıyorsanız doğrudan veritabanıyla, backendiyle frontendi ile satmayacaksınız. Her şey sizin sunucunuzda duracak siz hizmet olarak satacaksınız.
Bir başka yol ise siz kaynak kodları da verirsiniz ama sadece frontend kısmını verirsiniz (mesela angular, vue yada react gibi bir framework kullanırsınız), yani veritabanı bağlantısını yapan, veri çekme, kayıt gibi işlemleri yapan kısmı yine sizin sunucunuzda tutarsınız. Frontend ile sizin sunucunuz arasında API aracılığı ile veri alış verişi yaptırırsınız. Adam frontendi 1milyon kişiye de dağıtsa fark etmez sadece bir yerden çalışmasına müsaade etmiş olduğunuz için bir işe yaramaz. Yani kontrol sizde olur.

Kontrolün sizde olmasının tek yolu kodların sizin sunucunuzda barınmasıdır. Öteki türlü yukarıda söylediğim gibi sadece vakit kazanırsınız. O da 1-2 günü geçmez!

Kolay gelsin.