Birden fazla çağırmak için id yerine class kullanman gerekiyor. Aynı class içindekileri for ile döndürerek birden fazla grafik oluşturabilirsin.

window.onload = function() {
            var ctx = document.getElementsByClassName('canvas');
            for (var i = 0; i < ctx.length; i++) {
                ctx[i].getContext('2d');

                
                window.myBar = new Chart(ctx[i], {
                    type: 'bar',
                    data: barChartData,
                    options: {
                        responsive: true,
                        legend: {
                            position: 'top',
                        },
                        title: {
                            display: true,
                            text: ''
                        }
                    }
                });
            }
            

        };