Şöyle düşünün sitenizde cache var ve 1 adet style.css dosyanız var. Siz style.css diye yüklediniz gayet iyi her şey daha sonra cssde değişiklik yapıp tekrar yüklediniz cache olduğundan yaptığınız değişiklikler görünmeyecek eski hali ile açılacak bu yüzden style.css?ver=123 vs. diye herhangi bir versiyon yazılır ne yazıldığı önemli değil amaç bu css dosyası yeni diye belirtmektir cache bunu yeni olarak görür günceller. Büyük ihtimal cloudflare kullanıyorsunuz sorun ondan kaynaklı olabilir.
attığınız linklere girin ver'i silin eski hali görünecek ctrl+f5 yapın cache silinecek yeni halini göreceksiniz. Sitenize girip ctrl+f5 yapın en son hali ile karşılaşırsınız.
##Çözüldü
sorun cfde olduğunu zannetmiyorum sunucu değiştirdik apache'den litespeed'e geçtik sizce nerde olabilir sorun?