Tam olarak anlaamadım ama sanırım text dosyasından okumayı kastediiyorsun. Text dosyasından satır satır okuyarak veya tamamını okuyup satırlara ayırdıktan sonra, "," (virgül) split yaparak input datayı hazırlayabilirsin.

itemsetList.add(new HashSet<>(Arrays.asList("a", "b")));
yazan yere aşağıdaki kod yazarsan, belirttiğin dosyadaki verileri içeri aktarır..

try {
            List<Set<String>> itemsetList = new ArrayList<>();
            List<String> LINES = Files.readAllLines(Paths.get("c:apriori_data.txt"));
            for (String L : LINES) {
                HashSet<String> L_array = new HashSet<>();
                ObservableList<String> G = FXCollections.observableArrayList();
                G.addAll(L.split(","));
                L_array.addAll(G);
                itemsetList.add(L_array);
            }

        } catch (IOException ex) {
            Logger.getLogger(Main.class.getName()).log(Level.SEVERE, null, ex);
        }