Sektör için bir farkı yok. Yani yazılım alanında iş yapan bir firma için, bilgisayar ya da yazılım mühendisi olmanızın herhangi bir önemi yok.
Benim şahsi tavsiyem, sektöre biraz daha hızlı hazırlamaya zemin sağladığı için yazılım mühendisliğinden yana olacaktır.