bir örnek buldum , umarım işinize yarar
ffmpeg -i test.mp4 -i watermark.png -filter_complex "overlay=10:10" test1.mp4
bu link de açıklaması var.
Teşekkür ederim ihtiyacı olan işlem bu fakak benim için önemli olan misal sadece 10-20 sn arasında logo koymak