Yazı revizyonlarını da mı arama sonuçlarında gösteriyor ? Yoksa sürekli aynı sonucu defalarca tekrarlıyor mu?

Eğer aynı yazıyı defalarca tekrarlıyorsa Query kapatılmamış demektir:
endwhile; else : endif; bunların doğru yerde kapatıldığına bakmak gerekir

Eğer sayfalar gibi arama sonuçlarında görünmesini istemediğin sonuçlar görünüyorsa:

Bu kod sayfaları arama sonuçlarından kaldırır

function xxx() {
global $wp_post_types;
$wp_post_types['page']->exclude_from_search = true;
}
add_action('init', 'xxx');

Tıkladığında 404 hatası veriyorsa kalıcı bağlantıları resetle, bir de sayfalama yapısını gözden geçir. Eski model sayfalama kullanan bir teman varsa Query'de "paged" argümanının doğru kullanıldığından emin ol.
Birde bi kod yazsaydın da baksaydık anlasaydık sorun neymiş. Böyle havadan konuşuyorum