Excele yazdırmak için hangi sınıfı kullanıyorsunuz?
Veri tabanı bağlantısı yaparken charseti doğru ayarladınız mı?
Evet.
mysql_query("SET NAMES 'utf8'");
mysql_query("SET CHARACTER SET utf8");
mysql_query("SET COLLATION_CONNECTION = 'utf8_turkish_ci'");