Sorununu tam anlayamadım örnek vermediğin için ama sana bildiğim birkaç şeyi yazayım.

Bazı wp temalarda tarih kısmı gibi mesela yerlerde otomatik link veriliyor. Mesela benim ana sayfadam son 10 yazıda başlık altında eklenme tarihi oluyordu. Nasıl olduysa url kısmında orası 1970 olarak gözüküyordu. Fakat sunucu, yazı tarihleri vs. hepsi doğruydu. Bende olmayan sayfalar site/1970/ şeklinde oluyordu. O kısmı kaldırdım ve yönlendirme eklentisiyle site/1970 linklerini site/2018 e yönlendirdim.

Etiket konusunda bazen temadaki hatalar yüzünden sitede olmayan etiketler indexleniyordu. Sayfa 404 hatası verdiğinden google webmaster tools uyarı veriyordu. Temayı değiştirince bu sorunum çözüldü.

Bazı eklentiler ise başlıkları, kategori isimlerine otomatik etiket oluşturuyor. Mesela başlık "sitede ne sorun var çözemiyorum" eklenti kendisi "sitede-ne-sorun-var" şeklinde etiket oluşturup olmayan sayfa oluşturuyordu. Bilmediğiniz eklentileri kullanmayarak veya mevcut eklentilerin ayarlarını denetleyerek bunu kapatabilirsiniz. Ayrıca google webmaster tools üzerinden mutlaka hatalı url için sorun düzelti/yeniden gönder tarzı işlemleri yapın.