Merhabalar hocam dilerseniz ilk önce temanın eski çalışan dosyalarını ftp üzerinden atın dediğiniz gibi dosyaları karıştırmış olabilir eklenti ve buradan da hangi dosyalar karışık bilmem pek mümkün değil ancak dediğim gibi aklıma ilk gelen şey tema dosyalarını eğer yedeği varsa tekrar yüklemeniz eğer yok ise hosting yedeği muhtemelen vardır onu yükletmeyi deneyin..