consoleda görünmesinin size bir zararı yok, siteyede bir zararı yok.

404 sayfalarınız düzgün ayarlanmıssa bir sıkıntı olmaz.
Sayfaların ana sayfaya yönlenmediğinden, geçerli bir 404 sayfası hata kodu döndürdüğünden emin olun.
Herhangi bir 404 sayfasını google gibi getir yaptıgınız zaman (Bulunamadı) hatasını görmeniz lazım.

5000 tane hata var bende bi sorun olmuyor